O curso de doutorado em Engenharia Civil é um curso stricto sensu, com duração de até 54 meses. O ingresso se dá por meio de um processo seletivo que ocorre em fluxo contínuo, cujas inscrições podem ser feitas mensalmente até a data de fechamento da pauta da reunião da CCP do mês vigente. Podem se candidatar ao doutorado portadores de título de mestre reconhecido pelo MEC.