O curso de doutorado em Engenharia Civil é um curso stricto sensu, com duração de até 54 meses. O ingresso se dá por meio de um processo seletivo que ocorre em fluxo contínuo, cujas inscrições podem ser feitas do primeiro ao décimo dia útil de cada mês. Podem se candidatar ao doutorado portadores de título de mestre reconhecido pelo MEC.